税务风险

被追缴税款及滞纳金根据《企业所得税优惠政策事项办理办法》等规定，企业享受研发费用加计扣除优惠时，需留存备查包括立项决议文件等在内的相关资料。若未准备这些资料，一旦被税务机关查实，将面临被追缴已多扣除的税款，并按日加收滞纳金的后果。

面临罚款情节严重的，还可能被处以少缴税款 0.5-3 倍的罚款。

信用受损风险

纳税信用等级降低纳税信用等级会被降为 D 级，进而影响发票领用、出口退税、融资授信等多方面业务。例如，在融资时，银行等金融机构可能会因此提高贷款利率或拒绝贷款。

招投标资格受限可能被列入税收违法 “黑名单”，导致在参与招投标时因信用问题而失去资格。

优惠政策享受风险

无法享受后续优惠即使企业后续有了符合条件的研发项目，也可能因之前的违规行为，在一定期限内被限制享受研发费用加计扣除等税收优惠政策。

刑事责任风险若企业主观故意虚列研发费用、伪造立项报告等资料以骗取税收优惠，金额较大且情节严重的，可能涉及《刑法》第 201 条逃税罪，相关责任人将承担刑事责任。

科技研发型企业日常研究开发活动的管理

研发项目立项管理

明确立项标准与流程制定企业内部的研发立项标准和流程，规定哪些项目符合研发方向和战略目标，需提交详细的项目计划书，包括研发背景、目标、技术路线、预期成果等内容。经企业有权部门，如董事会等进行严格评审和决策，形成正式的立项决议文件。

项目编号与备案对每个立项的研发项目进行唯一编号，并在企业内部的研发管理系统中进行备案登记，同时根据相关政策要求，到科技行政主管部门进行登记或备案，以便享受相关优惠政策时有据可查。

研发人员管理

建立研发人员档案详细记录研发人员的专业背景、技能水平、工作经验等信息，明确其在各个研发项目中的角色和职责，并将研发人员名单与立项项目进行关联，以便准确核算人员人工费用。

研发工时统计与管理利用项目管理软件或工时表等工具，要求研发人员记录每日在不同研发项目上的工作时间，以此为依据合理分配人员薪酬到相应的研发项目成本中，确保人员人工费用的归集准确无误。

研发费用管理

设置辅助账按照研发项目设置 “研发支出” 辅助账，对各项研发费用进行明细核算，区分费用化和资本化支出，准确归集人工费用、直接投入费用、折旧费用、无形资产摊销、新产品设计费等各类研发费用，并按要求填写《研发费用加计扣除优惠明细表》。

费用审核与控制建立严格的费用审批制度，对研发费用的支出进行事前、事中和事后的审核，确保费用支出的真实性和合理性，防止费用的浪费和不合理归集。定期对研发费用的支出情况进行分析和评估，及时发现和解决费用异常问题。

研发过程管理

项目进度跟踪建立项目跟踪机制，定期对研发项目的进展情况、技术难题攻克情况、阶段性成果等进行检查和评估，及时调整项目计划和资源配置，确保项目按计划顺利推进，同时记录研发过程中的各种情况和问题，形成过程性文件，如项目进度报告、技术方案调整记录等，为后续的研发费用核算和成果验收提供依据。

质量控制与风险管理制定研发项目质量控制标准和风险管理制度，对研发过程中的各个环节进行质量监控，确保研发成果符合预期的质量要求。同时，识别和评估研发过程中可能出现的技术风险、市场风险、资金风险等，并制定相应的应对措施，降低风险对研发项目的影响。

研发成果管理

成果验收与评价研发项目完成后，组织内部专家或外部专业机构对研发成果进行验收和评价，出具项目结题报告、成果鉴定报告等，详细说明研发成果的创新性、实用性、先进性以及对企业的价值和贡献等，为研发费用加计扣除等优惠政策的享受提供有力支持。

知识产权保护及时对研发过程中形成的专利、商标、著作权等知识产权进行申请和登记，加强知识产权的保护和管理，充分发挥知识产权在企业技术创新和市场竞争中的作用，同时也可以作为研发活动真实性和有效性的证明资料。

资料收集与档案管理

研发资料收集在研发活动的全过程中，指定专人负责收集和整理相关资料，包括项目计划书、立项决议文件、研发合同、费用凭证、测试报告、研发人员名单及工时记录、成果报告等，确保资料的完整性和准确性。

档案管理与保存建立研发资料档案管理制度，对收集到的资料进行分类、编号和归档，按照规定的保存期限进行妥善保存，一般研发费用加计扣除留存备查资料应从企业享受优惠事项当年的企业所得税汇算清缴期结束次日起保留 10 年，以便在税务机关检查或企业内部审计时能够及时提供相关证明资料。